Data Manager H/F - Cohorte Filomene

La cohorte FILOMENE est un projet de très grande envergure qui vise à inclure 100 000 enfants, en recrutant leur mère dès la grossesse. Une première étude de faisabilité doit être mise en œuvre rapidement afin de tester les différentes modalités d'inclusion des futures mamans et les modalités de recueil de données et de matériel biologique au cours des premières années de suivi de cette future grande cohorte. Une équipe de pilotage est constituée autour des deux investigateurs principaux (une chercheuse en épidémiologie et un pédiatre), la coordinatrice du projet, une chef de projet, une chargée de communication et une assistante d'enquête. Cette équipe sera complétée avec l'ingénieur d'étude recruté(e).

La mise en place de la cohorte nécessite le développement d'un outil informatique de gestion et de collecte complexe qui sera déployé par un prestataire, en lien avec l'infrastructure France Cohortes (https://francecohortes.org). La personne recrutée aura pour mission, en lien avec ces deux acteurs et l'équipe de coordination, de participer au déploiement de cet outil, d'assurer le contrôle des données recueillies puis de mettre en œuvre leur mise à disposition à la communauté scientifique.

Activités principales :

1. Développement de l'outil de gestion et de collecte

• Développer et paramétrer les questionnaires en ligne (une formation au logiciel utilisé sera donnée).
• Développer les contrôles de cohérence automatiques.
• Tester les outils avant leur mise en production
• Concevoir le dictionnaire de données
• Gérer les profils utilisateurs

2. Gestion et contrôle de la qualité des données

• Superviser l'intégration des données provenant de différentes sources (questionnaires, dossiers médicaux, laboratoires, objets connectés, etc.).
• Vérifier l'exhaustivité des données recueillies.
• Mettre en place des processus de contrôle de qualité des données (Identifier les incohérences, doublons ou valeurs aberrantes ..)
• Émettre et suivre les demandes de clarification (queries) auprès des équipes terrain.
• Traitement des questions des utilisateurs
• Mettre en place des indicateurs de qualité.

3. Reporting et documentation.

• Produire des rapports d'avancement de l'étude (inclusions, questionnaires complétés) qui seront présentés lors des comités de pilotage.
• Rédiger l'ensemble des documents
• Rédaction de la documentation technique sur les traitements effectués (catalogues de variables, questionnaires annotés, procédures de data management, documentation descriptive des collectes),

4. Gestion des données

• Nettoyer les bases de données.
• Création de variables construites à partir de variables source
• Produire les jeux de données destinés aux chercheurs et accompagner les utilisateurs dans l'exploitation des fichiers
• Documenter les transformations effectuées.
• Préparer les fichiers d'export dans les formats requis (SAS, R, STATA, CSV, etc.).

5. Conformité règlementaire

• Garantir la confidentialité des données de santé.
• Assurer le respect du RGPD et des réglementations applicables.
• Organiser la pseudonymisation ou l'anonymisation des données.
• Gérer les clés de chiffrement

Connaissances :

• Parfaite maîtrise du logiciel R
• Connaissance des langages de programmation dont au moins un langage de programmation web (ex :php .) et un langage généraliste (ex: python)
• Bonne pratique des logiciels de bureautique (Word, Excel)
• Utilisation de gestionnaire de packages (comme Nexus)
• Maîtrise d'un outil de gestion de configuration (ex: GIT)
• Connaissance d'un framework de tests unitaires
• La connaissance d'un standard de modélisation de données issues d'enquêtes (ex: DDI-L) serait un plus

Aptitudes :

• Esprit d'analyse et de synthèse pour comprendre les demandes rapidement et présenter les résultats,
• Rigueur,
• Capacités rédactionnelles,
• Sens des responsabilités, autonomie et rigueur,
• Aptitude